Ang Pinakamalaking hanay ng mga Mammalian Genome ay Nagpapakita ng Mga Uri ng Panganib na Panganib

Ang isang pangunahing internasyonal na koalisyon na pinamunuan ng mga siyentista sa Uppsala University at ang Broad Institute of MIT at Harvard ay nasubaybayan ang 130 na mga genetic mammal at sinuri ang 110 data at mga genome na nagpapahintulot sa mga siyentista na kilalanin ang mga pangunahing posisyon sa DNA. Ang bagong kaalamang ito ay makakatulong sa parehong pagsasaliksik sa mga mutasyon sa mga tao at kung paano makatipid ng mga endangered species. Ang pag-aaral ay na-publish sa Kalikasan. Kredito: Susanna Hamilton

Ang proyekto ng Zoonomia ay pinakawalan ang malaking database na ito upang mapalawak ang parehong pananaliksik sa biological at conservation.
Ang isang pangkat ng mga mananaliksik sa internasyonal sa pagsisikap na tinawag na Zoonomia Project ay sinuri at inihambing ang buong genome sa higit sa 80 porsyento ng lahat ng mga mammal na pamilya, na sumasaklaw sa halos 110 milyong taon ng ebolusyon. Genomic database, na-publish ngayon (Nobyembre 11, 2020) sa Kalikasan, kabilang ang mga genome mula sa higit sa 120 dating walang kaugnay na mga species, at nakukuha nila ang pagkakaiba-iba ng mga mammal sa isang walang uliran na rate.

Nilalayon ng database na isulong ang pagsasaliksik sa kalusugan ng tao. Maaaring gumamit ang mga mananaliksik ng data upang ihambing ang mga gen ng tao sa ibang mga mammal, na maaaring makatulong na makilala ang mga genomic na rehiyon na maaaring kasangkot sa mga karamdaman ng tao. Ginagawa ring magagamit ng mga may-akda ang database sa pang-agham na pamayanan sa pamamagitan ng website ng Zoonomia Project, nang walang mga paghihigpit sa paggamit.

“Ang pangunahing ideya ng proyekto ay upang paunlarin at gamitin ang data na ito upang matulungan ang mga genetista na makilala ang mga mutasyon na sanhi ng sakit,” sinabi ng co-author na si Kerstin Lindblad-Toh, direktor ng vertebrate genomics sa Broad at isang propesor ng comparative genomics sa Uppsala University .

Gayunpaman, sa pagsusuri ng mga bagong genome, natagpuan din ng mga may-akda na ang mga species ng mammal na may mataas na antas ng pagkalipol ay may kaunting pagkakaiba-iba ng genetiko. Iminungkahi ng mga natuklasan na ang isang pagkakasunud-sunod ng nag-iisang tao ay maaaring magbigay ng mahalagang impormasyon, mabisang gastos, kung saan mas malaki ang peligro ng pagkalipol ng mga indibidwal at dapat unahin para sa malalim na pagtatasa ng mga pangangailangan sa pag-iingat.

“Nagsulat kami ng isang papel upang pag-usapan ang napakalaking, natatanging database at ipaliwanag kung bakit ito kawili-wili. Kapag nagawa mo nang mas malawak na magamit ang data at ipinaliwanag kung bakit ito gumagana para sa mas malawak na pamayanan ng pananaliksik, talagang mababago mo ang paraan ng paggawa ng agham, “sinabi ng kapwa may-akda na si Elinor Karlsson, direktor ng Vertebrate Genomics Group sa Broad Institute of NE at Harvard at propesor sa University of Massachusetts Medical School.
Ang data ng Zoonomia ay nakatulong na sa mga mananaliksik sa kamakailang pagsasaliksik upang masuri ang panganib ng impeksyon sa SARS-CoV-2 sa maraming mga species. Nakilala ng mga mananaliksik ang 47 na mga mammal na mas malamang na maging mga pool o intermediate carrier ng SARS-CoV-2 na virus.

Pagma-map ng mga mammal

Ang Zoonomia Project, dating kilala bilang 200 Mammals Project, ay itinatayo sa nakaraang proyekto, ang 29 Mammals Project, na naglunsad ng isang genetiko na pagkakasunud-sunod ng mga mammal noong 2006. ‘t, mula sa magdamag na natutulog na mga ardilya hanggang sa buhay na paniki. Kasama rin sa proyekto ang mga patay na gen.

Sa isang bagong pag-aaral, nakipagtulungan ang mga mananaliksik sa 28 magkakaibang mga institusyon sa buong mundo upang mangolekta ng mga sample ng pagsusuri sa genomic, kasama ang Frozen Zoo sa San Diego Global Zoo na nagbibigay ng halos kalahati ng mga sample. Ang koponan ay nakatuon sa mga uri ng mga interes ng pangangalaga ng medikal, biological at biodiversity at nadagdagan ang porsyento ng mga pamilyang mammalian na may genome na kumakatawan mula 49 hanggang 82.

Ang proyekto ay bumuo din at nagbahagi ng mga tool na makakatulong sa mga mananaliksik na tingnan ang buong “libro” o batayan ng mammalian genome at ihambing ito sa pagkakasunud-sunod ng mga parallel na kadahilanan ng genetiko sa isang tao, kabilang ang mga rehiyon na maaaring kasangkot sa sakit. Makatutulong ito sa mga mananaliksik na kilalanin ang mga variable ng genetiko na higit pa o mas kaunti sa kapareho ng ebolusyon at ng mga random mutation. Kung ang site ay mananatiling matatag para sa mga mamal sa paglipas ng milyun-milyong taon, marahil ito ay may isang mahalagang pag-andar, kaya’t ang anumang mga pagbabago sa site na iyon ay maaaring maiugnay sa sakit.

Sa paglalathala ng data, nanawagan ang mga may-akda sa pamayanang pang-agham na suportahan ang mga mananaliksik sa larangan sa pagkolekta ng mga sample, pagpapalawak ng pag-access sa mga mapagkukunan na nagpapahintulot sa pagsusuri ng malalaking mga database ng genomic, at mabilis na ibahagi ang data ng genomic.

“Ang isa sa mga magagaling na bagay tungkol sa Zoonomia Project ay ang karamihan sa aming mga pangunahing katanungan na magagamit sa mga tao sa loob at labas ng agham,” sinabi ng pinuno ng may-akda na si Diane Genereux, isang siyentipikong mananaliksik sa Vertebrate Genomics Group sa Broad. “Sa pamamagitan ng pagdidisenyo ng mga proyekto sa agham na naa-access sa lahat, masisiguro natin ang mga benepisyo sa lipunan, tao at pangkapaligiran.”

Sanggunian: “Paghahambing ng genomics multitool para sa pagtuklas ng pang-agham at pag-iingat ng” sa pamamagitan ng Zoonomia Consortium, Nobyembre 11, 2020, Kalikasan.
DOI: 10.1038 / s41586-020-2876-6

Ang proyekto ay bahagyang pinondohan ng NHGRI, ang Sweden Research Council, ang Knut at Alice Wallenberg Foundation, Broadnext10, at iba pa.

Related articles

Comments

LEAVE A REPLY

Please enter your comment!
Please enter your name here

Share article

Latest articles

Pagkuha ng Impormasyon sa Kasaysayan ng Neanderthal na Populasyon Gamit ang Sinaunang Nuclear DNA Mula sa Mga Ciment Sediment

Gallery sa lugar ng yungib ng mga estatwa sa hilagang Espanya. Kredito: Javier Trueba - Madrid Scientific Films Ang Mitochondrial DNA ng mga archaic...

Kung Paano Maaaring Lumaki ang Iba Pang Mga Karamdaman na Fungi Sa Maliit na Puwang

Ang isang pangkat na pinangunahan ng Tsukuba University ay natagpuan ang isang makabuluhang pagkakaiba na nagpapaliwanag kung bakit ang ilang mga species ng fungi...

Para sa Mga Tatanggap ng Transplant, Isang Pangatlong Dosis ng Bakuna sa COVID Maaaring Mag-alok ng Mas mahusay na Proteksyon

Ipinakita ng mga mananaliksik sa Johns Hopkins Medicine na tatlong dosis ng bakuna laban sa SARS-CoV-2-ang virus na sanhi ng pagtaas ng antas ng...

Ang mga sigla ng usok na nasa daang siglo na napanatili sa niyebe ay nagbubunyag ng isang maalab na nakaraan – at ang hinaharap...

Inisyu ni Harvard John a. Paulson School of Engineering at Applied Science Hunyo 18, 2021 Ang usok mula sa mga wildfires na gawa ng tao...

Inihanda ng NASA ang “Moonikin” na kumander para sa Artemis 1 lunar na misyon

Sa larawang ito, sinusubukan ng mga inhinyero ang isang pagsubok na panginginig ng boses sa upuan ng Orion at ang Chemini Space Center -...

Newsletter

Subscribe to stay updated.